對于主軸螺母、軸承位的密封，以前的傳統機型在這方面的密封措施比較簡易，只能做到相對密封。如主軸螺母部位，主軸螺母與轉鼓接合面，一般不設置密封圈，GK刮刀卸料離心機在運行過程中液相、氣相滲入，對主軸錐面產生腐蝕，甚至滲入軸承中，對軸承產生破壞，從而影響機器的正常使用。上軸承蓋一般都設置骨架式密封等結構，但上軸承蓋與轉鼓錐孔之間的一部分則暴露在外，GK刮刀卸料離心機內腔中的氣相，則可能對主軸暴露面產生腐蝕。
 制藥行業所用的GK刮刀卸料離心機，其所分離的物料中大都有機溶劑或酸、堿、鹽等介質，因此在訂購設備時應充分考慮到這些部位的密封要求，設置動密封或靜密封結構，以達到密封要求。